MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 31231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_013203	CCA	2	6	1532906	1532911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257785156
31003	NC_013203	AG	3	6	1532971	1532976	50 %	0 %	50 %	0 %	257785156
31004	NC_013203	TGC	2	6	1533167	1533172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785156
31005	NC_013203	CTA	2	6	1533194	1533199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785156
31006	NC_013203	GCAA	2	8	1533272	1533279	50 %	0 %	25 %	25 %	257785156
31007	NC_013203	TGC	2	6	1533290	1533295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785156
31008	NC_013203	TGCT	2	8	1533301	1533308	0 %	50 %	25 %	25 %	257785156
31009	NC_013203	AGA	2	6	1533311	1533316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257785156
31010	NC_013203	GTTG	2	8	1533368	1533375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_013203	AGA	2	6	1533415	1533420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_013203	TAC	2	6	1533425	1533430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785157
31013	NC_013203	CGT	2	6	1533432	1533437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31014	NC_013203	TTC	2	6	1533439	1533444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257785157
31015	NC_013203	TTG	2	6	1533477	1533482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257785157
31016	NC_013203	TGA	2	6	1533594	1533599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257785157
31017	NC_013203	GAC	2	6	1533600	1533605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31018	NC_013203	TTG	2	6	1533618	1533623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257785157
31019	NC_013203	CCA	2	6	1533652	1533657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257785157
31020	NC_013203	TCT	2	6	1533665	1533670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257785157
31021	NC_013203	CAC	2	6	1533730	1533735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257785157
31022	NC_013203	GCA	2	6	1533755	1533760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31023	NC_013203	TCCC	2	8	1533766	1533773	0 %	25 %	0 %	75 %	257785157
31024	NC_013203	GAA	2	6	1533842	1533847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257785157
31025	NC_013203	GCAA	2	8	1533859	1533866	50 %	0 %	25 %	25 %	257785157
31026	NC_013203	GGT	2	6	1534423	1534428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257785157
31027	NC_013203	TGC	2	6	1534444	1534449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31028	NC_013203	TTC	2	6	1534450	1534455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257785157
31029	NC_013203	TC	3	6	1534511	1534516	0 %	50 %	0 %	50 %	257785157
31030	NC_013203	CCA	2	6	1534553	1534558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257785157
31031	NC_013203	TGC	2	6	1534612	1534617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31032	NC_013203	GCA	3	9	1534634	1534642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31033	NC_013203	AGC	2	6	1534664	1534669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31034	NC_013203	GGC	2	6	1534687	1534692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257785157
31035	NC_013203	AGC	2	6	1534702	1534707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31036	NC_013203	TCC	2	6	1534729	1534734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257785157
31037	NC_013203	AGC	2	6	1534736	1534741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31038	NC_013203	AGG	2	6	1534843	1534848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257785157
31039	NC_013203	CAG	2	6	1534863	1534868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31040	NC_013203	TAG	2	6	1534879	1534884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257785157
31041	NC_013203	AG	3	6	1534886	1534891	50 %	0 %	50 %	0 %	257785157
31042	NC_013203	CAC	2	6	1534900	1534905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257785157
31043	NC_013203	GC	3	6	1534922	1534927	0 %	0 %	50 %	50 %	257785157
31044	NC_013203	ATA	2	6	1534960	1534965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257785157
31045	NC_013203	CTG	2	6	1534989	1534994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785157
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31048	NC_013203	GCT	2	6	1535177	1535182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31049	NC_013203	CAT	2	6	1535334	1535339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785157
31050	NC_013203	GACA	2	8	1535449	1535456	50 %	0 %	25 %	25 %	257785157
31051	NC_013203	GCA	2	6	1535553	1535558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31052	NC_013203	GTC	2	6	1535575	1535580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31053	NC_013203	CAA	2	6	1535613	1535618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257785157
31054	NC_013203	AAC	2	6	1535716	1535721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257785157
31055	NC_013203	TTCTTT	2	12	1535722	1535733	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	257785157
31056	NC_013203	TCCAC	2	10	1535769	1535778	20 %	20 %	0 %	60 %	257785157
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31063	NC_013203	GC	3	6	1536120	1536125	0 %	0 %	50 %	50 %	257785157
31064	NC_013203	TCG	2	6	1536137	1536142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785157
31065	NC_013203	CAA	2	6	1536192	1536197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257785157
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31067	NC_013203	GCA	2	6	1536239	1536244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785157
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31072	NC_013203	GAA	2	6	1536396	1536401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31073	NC_013203	TTC	2	6	1536406	1536411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31074	NC_013203	CCG	2	6	1536517	1536522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257785158
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31082	NC_013203	CTA	2	6	1536845	1536850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785158
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31084	NC_013203	CG	3	6	1536929	1536934	0 %	0 %	50 %	50 %	257785158
31085	NC_013203	TGCC	3	12	1537067	1537078	0 %	25 %	25 %	50 %	257785158
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31087	NC_013203	CAT	2	6	1537223	1537228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785158
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31089	NC_013203	GCC	2	6	1537365	1537370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257785158
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31092	NC_013203	TCT	2	6	1537467	1537472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31093	NC_013203	AGA	2	6	1537492	1537497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31096	NC_013203	GAA	2	6	1537695	1537700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257785159
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31099	NC_013203	CT	3	6	1537905	1537910	0 %	50 %	0 %	50 %	257785159
31100	NC_013203	GAC	2	6	1538031	1538036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785159
31101	NC_013203	AC	3	6	1538041	1538046	50 %	0 %	0 %	50 %	257785159
31102	NC_013203	GTT	2	6	1538058	1538063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257785159
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31105	NC_013203	GTC	3	9	1538350	1538358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785159
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31107	NC_013203	CAT	2	6	1538456	1538461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785159
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31109	NC_013203	AGAAA	2	10	1538614	1538623	80 %	0 %	20 %	0 %	257785159
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31111	NC_013203	ATA	2	6	1538664	1538669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_013203	AAG	2	6	1538672	1538677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31113	NC_013203	CTT	2	6	1538694	1538699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31114	NC_013203	CGC	2	6	1538796	1538801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31115	NC_013203	ATC	2	6	1538812	1538817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.